Oddelenie biológie ÚBB zabezpečuje v rámci študijného odboru 3. Biológia študijné programy v troch stupňoch vysokoškolského štúdia:
Študijný program aplikovaná biológia sa zameriava, popri klasických biologických predmetoch, na moderné biologické disciplíny ako sú molekulárna biológia, genomika, proteomika, bioinformatika, biomolekulový dizajn a iné. V neposlednom rade je program zameraný na predmety akcentujúce biologické aspekty prírodovedy, na ekologické a environmentálne disciplíny, ako aj predmety zahrňujúce problematiku trvale udržateľného rozvoja.
Program bakalárskeho študijného programu Aplikovaná biológia (Bc.) má za cieľ formovať poslucháča v prvom stupni vysokoškolského štúdia tak, aby nadobudol primerané poznatky zo základných prírodovedeckých disciplín, predovšetkým biológie, ako aj ich hraničných oblastí. Absolventi odboru Biológia môžu hľadať uplatnenie v širokom rozpätí pracovísk s biologickým a chemickým zameraním vo výskumných kolektívoch, i v samostatnej práci s výskumno-technickým zameraním. Majú schopnosť rozhodnúť sa samostatne pri riešení problémov a navrhovaní opatrení, sú spôsobilí podieľať sa tvorbe projektov a úspešne ich realizovať v praxi. Absolvovanie štúdia vytvára predpoklady pre pokračovanie v štúdiu na druhom stupni toho istého odboru, ale aj v niektorom z príbuzných študijných odborov.
Absolventi magisterského študijného programu Aplikovaná biológia (Mgr.) dokážu riešiť problémy biologického výskumu, praktické úlohy aplikovanej biológie, má poznatky a zručnosti v metódach výskumu živých systémov na rôznych úrovniach ich organizácie (molekula, bunka, organizmus, populácia, ekosystém). V rámci študijného programu získajú potrebné teoretické i praktické poznatky, skúsenosti a návyky, ktoré im umožnia pochopiť podstatné fakty, princípy a teórie v biológii, poznať súvislosti medzi biológiu a ďalšími prírodovednými odbormi, dokázať interdisciplinárne skúmať a poznávať podstatu prírodných technických i spoločenských procesov prebiehajúcich okolo nás. Absolventi sú schopní tvoriť projekty, a úspešne ich realizovať v praxi. Po ukončení magisterského štúdia môže absolvent študijného programu Aplikovaná biológia pokračovať v doktorandskom štúdiu v odbore biológia.
Absolvent doktorandského študijného programu Molekulárna biológia (PhD.) je schopný samostatne a tvorivo vedecky pracovať v rozličných oblastiach biológie, ako aj v hraničných disciplínach. Absolvent ovláda vedecké prístupy a metodológiu výskumu vo zvolených aplikačných oblastiach aplikovanej biológie s využitím najmodernejších metód molekulárnej biológie a genetiky. Je tiež spôsobilý navrhovať, riadiť a objektívne vyhodnocovať problémovo orientované experimenty, zamerané na závažné problémy súčasnej spoločenskej praxe. Vykonáva činnosť aj v rôznych ďalších oblastiach spoločenskej praxe, pri zabezpečovaní a riadení kvality, v monitoringu životného prostredia, vo farmaceutickej, v klinickej biochémii, molekulárnej medicíne, v potravinárstve a inde. Má základné manažérske schopnosti, zamerané na uplatňovanie aplikovanej biológie v praxi,dokáže viesť výskumný kolektív, plánovať tímové úlohy a má tiež vedomosti o relevantných environmentálnych, ekonomických, právnych a etických aspektoch. Na základe získaných vedomostí je absolvent študijného programu spôsobilý vyučovať špecializované biologické predmety na vysokej škole.
Nosné témy jadra znalostí pre študijný program aplikovaná biológia sú: